Амирова задержали в июне 2013 года. По версии следствия, он организовал убийство дагестанского следователя Арсена Гаджибекова и планировал уничтожить своего политического оппонента, главу дагестанского Пенсионного фонда. Для этого Амиров вместе с племянником готовился сбить самолет, а потом списать нападение на местных боевиков, утверждало следствие.
Обвинение потребовало приговорить Амирова к 13 годам лишения свободы. По мнению прокурора, бывший градоначальник должен отбывать наказание в колонии строгого режима. Также обвинитель попросил суд лишить Амирова Ордена Дружбы и Ордена «За заслуги перед Отечеством II степени».
