Версию об уничтожении тел убитых с помощью серной кислоты и огня опровергли. Был проведен следственный эксперимент, доказавший, что такого быть не могло. По словам Молодцовой, дело было возобновлено в 2015 году, с тех пор было назначено 37 судебных экспертиз в том числе судебно-медицинские (антропологические), молекулярно-генетические, почерковедческие и другие.
В районе Поросенкова лога под Екатеринбургом еще в 2007 году были найдены человеческие останки. После проведенных экспертиз выяснилось, что это кости убитых цесаревича Алексея и великой княжны Марии. Как заявила старший следователь, недалеко от этого места могут находится и другие захоронения.
3D-модель шляпы Николя II может помочь доказать, что один из найденных черепов – останки последнего императора. На его черепе должны были остаться следы от ранений, которые он получил при покушении в Японии. В Эрмитаже находится шляпа, которая была на Николае во время нападения. Если следы от ран на черепе и на шляпе совпадут, то следствие сможет подтвердить то, что найденные останки принадлежат именно императору.
В 1918 году император Николай II и его семья были расстреляны в Екатеринбурге. В 1991 году в месте под названием Поросенков лог были обнаружены останки царской четы и трех княжон. В 2007 году было найдено еще одно захоронение неподалеку. В 2000 году Русская православная церковь причислила Николая II и членов его семьи к лику святых, однако РПЦ не признала найденные останки подлинными из-за недостатка доказательств. В 2018 году, после проведения экспертиз, было установлено, что останки принадлежат членам царской семьи.