Юрий Исаев окончил экономический факультет Московского авиационного института. Был президентом – председателем совета директоров ОАО "Банк Российский кредит" и ООО "ИМПЭКСБАНК", замминистра экономического развития и торговли РФ, советником первого замглавы ФСБ РФ, председателем правления ОАО "Российский Банк Развития".
В 2008 – 2013 годах был депутатом Госдумы РФ пятого и шестого созывов, зампредседателя комитета Госдумы по финансовому рынку. С 2013 по 2022 год занимал пост гендиректора госкорпорации "Агентство по страхованию вкладов". С января 2022 г. – заместитель председателя Банка России. В апреле 2022 года был назначен членом Совета директоров Банка России.