Модернизация сопровождалась ремонтом корпуса, донно-забортной арматуры и прочих общекорабельных систем. Ключевые изменения коснулись вооружения корабля. Вместо противолодочного ракетного комплекса «Раструб» был установлен противокорабельный ракетный комплекс «Уран» – 8 ракет в двух счетверенных пусковых установках. Кроме того, «Шапошников» получил универсальный корабельный стрельбовый комплекс (УКСК), позволяющий использовать всю номенклатуру вооружения ракетных комплексов «Калибр» и «Оникс» (16 ракет в двух пусковых установках 3С14), включая противокорабельные, противолодочные ракеты и крылатые ракеты большой дальности для поражения наземных целей.
Пусковые установки УКСК были смонтированы на месте одной из двух 100-мм артиллерийских установок АК-100 в носовой части корабля. Вторая установка АК-100 была заменена на более современную А-190. Кроме того, на корабле обновлены системы ПВО, радиоэлектронное оборудование, системы управления и др.
После прохождения первого этапа испытаний фрегат вернется на Дальзавод для завершения ремонта.
Всего в настоящее время в состав ВМФ РФ входят 8 кораблей проекта 1155, из которых четыре (включая «Шапошников») должны быть модернизированы в течение ближайших десяти лет, что позволит продлить их срок службы до 2040-х годов. Остальные БПК будут заменяться кораблями новой постройки.
Ранее сообщалось, что БПК «Маршал Шапошников» после модернизации сможет использовать новейшие гиперзвуковые ракеты «Циркон». Также ракеты этого типа будут применяться с новых и модернизированных подводных лодок, а также перспективных фрегатов и корветов ВМФ России новой постройки.