Новый метод изучения эволюции белков разработали в России
Специалисты Федерального исследовательского центра биотехнологии РАН разработали алгоритм MAHDS (Multiple Alignments of Highly Diverged Sequences), который позволяет сравнивать аминокислотные последовательности белков, разошедшихся в процессе эволюции на сотни миллионов лет. Метод превзошел зарубежные аналоги в точности анализа высокодивергентных структур – белков с крайне низкой схожестью из-за длительного эволюционного пути. Об этом сообщает ТАСС в пятницу, 4 апреля.

(Иллюстрация)
©Stock-Asso/Shutterstock/FotodomMAHDS основан на математической модели, использующей метод Монте-Карло для оценки вероятностных совпадений в последовательностях. В ходе тестирования на 490 белковых семействах российский алгоритм успешно выявил эволюционные связи в 138 случаях, где другие методы показали лишь случайные совпадения.
Особенность MAHDS – способность находить скрытые закономерности даже при минимальной схожести белков. Это критично для изучения древних организмов и реконструкции этапов эволюции. Например, метод помогает определить, как изменения в структуре белков повлияли на развитие многоклеточных или адаптацию к экстремальным условиям.
Для удобства ученых создан открытый онлайн-сервер, где можно загрузить данные и получить анализ. Инструмент уже используют в исследованиях происхождения архей и эукариот.
Алгоритм MAHDS открывает новые возможности для российской эволюционной биологии и медицины. Понимание древних мутаций в белках поможет расшифровать механизмы наследственных заболеваний и создать лекарства, нацеленные на древние участки ДНК.
Читайте на смартфоне наши Telegram-каналы: Профиль-News, и журнал Профиль. Скачивайте полностью бесплатное мобильное приложение журнала "Профиль".