Хуснутдинов был выбран "Миннесотой" на драфте НХЛ 2020 года под общим 37 номером. Перед переездом в США хоккеист расторг свое действующее соглашение с клубом Континентальной хоккейной лиги (КХЛ) "Сочи". Договор с игроком был заключен до 30 апреля, но представитель форварда инициировал досрочное прекращение контракта. В клубе это решение удовлетворили. Пресс-служба также сообщила, что в апреле "Сочи" собирается сделать Хуснутдинову квалификационное предложение с целью сохранения спортивных прав на игрока. Об этом пишет ТАСС.

В сезоне-2023/24 Хуснутдинов пришел в "Сочи" после того как был обменян из петербургского СКА. За прошедший регулярный чемпионат КХЛ в составе "Сочи" хоккеист провел 49 матчей, набрав 20 очков (шесть шайб и 14 голевых передач).

В 2019 году Марат Хуснутдинов перешел в систему СКА из подмосковного "Витязя". Он выступал за основную петербургскую команду с 2020 года. В Молодежной хоккейной лиге в 2022 году форвард в составе "СКА-1946" стал победителем. В сборной России Хуснутдинов участвовал в молодежном Чемпионате мира 2021 года и юниорском Чемпионате мира 2019 года, где выиграл серебро. Он также выступал в составе основной национальной команды на первом этапе Евротура в ноябре 2021 года.