«Я не признаю себя виновным в совершении преступлений, о которых говорится в обвинительном акте. Я знаю это достоверно, постараюсь, уважаемый суд, довести до вас свою позицию, основанную на том, что мне известно», — сказал Бишимбаев.
Он также добавил, что, оказавшись на скамье подсудимых, подвел президента Казахстана Нурсултана Назарбаева и всех казахстанцев.
Бишимбаев был освобожден от должности министра в конце декабря 2016 года. Министр был отстранен от должности в связи с возникшими вопросами по его деятельности в холдинге «Байтерек».
13 января 2017 года он был арестован судом по подозрению в получении взяток в особо крупном размере.