Поводом для судебных разбирательств стал до сих пор не реализованный проект по строительству железнодорожной линии Кызыл–Курагино (протяженностью более 400 км), который должен связать Туву с Красноярским краем и, в целом, железнодорожной сетью страны. В декабре 2011 года конкурс по контракту строительства ветки выиграло ООО «Стройновация» – инжиниринговая компания, реализующая проекты в сфере строительства нефтегазовой промышленности, транспортной инфраструктуры, промышленных объектов. Финансирование предусматривалось за счет бюджетных ассигнований Инвестиционного фонда РФ. Альфа-банк предоставил банковскую гарантию на сумму 14 млрд руб. в обеспечение обязательств «Стройновации» перед Федеральным агентством железнодорожного транспорта (Росжелдор).

В октябре 2012 года в Министерстве транспорта РФ решили прекратить реализацию проекта, в связи с чем Росжелдор направил в адрес ООО «Стройновация» соглашение о расторжении государственного контракта. 18 октября 2013 года в адрес Альфа-банка, выступавшего гарантом, в связи с нарушением ООО «Стройновация» сроков выполнения работ по госконтракту поступило требование от Росжелдора об уплате остатка не использованных средств аванса в размере 5 млрд руб. Банк уведомил об этом «Стройновацию» и исполнил требование Росжелдора, уплатив ему 5 млрд руб. В декабре 2013 года «Стройновация» погасила задолженность (образовавшуюся в порядке регресса) в размере 5 млрд руб. перед Альфа-банком, что свидетельствует о согласии с произведенными выплатами. Однако позже «Стройновация» обратилась в суд с иском к банку о возврате суммы гарантии и процентов за пользование этими средствами, так как решила, что Альфа-банк должен был ждать результатов ее спора Росжелдором.

Решением от 16.10.2015 года Арбитражный суд г. Москвы (первая инстанция) частично удовлетворил исковые требования. Суд взыскал с Банка в пользу ООО «Стройновация» в размере Якорь5,048 млрд рублей, проценты за пользование чужими денежными средствами – 540,3 млн рублей, и убытки в размере Якорь494,9 млн рублей.

Банк подал апелляционную жалобу, также решение обжаловали ООО «Стройновация» и Росжелдор. Постановлением Апелляционной инстанции – Девятым арбитражным апелляционным судом 11 февраля 2016 года решение Арбитражного суда города Москвы было отменено, в иске ООО «Стройновация» к Банку о взыскании 6,083 млрд руб. было отказано. Однако «Стройновация» обжаловала это решение. И 22 июня 2016 года Арбитражный суд Московского округа (АС МО) удовлетворил жалобу заявителя – отменил постановление апелляционного суда, оставив в силе решение суда первой инстанции.

Альфа-банк подал в судебную коллегию по экономическим спорам Верховного суда РФ кассационную жалобу и ходатайство о приостановлении исполнения судебного акта. ВС РФ приостановил исполнение решения Арбитражного суда г. Москвы и постановления АС МО.

31 октября 2016 года Верховный суд подтвердил правоту Альфа-банка и признал, что банк действовал единственно возможным образом, выполняя свои обязательства перед Росжелдором. В данной ситуации банк не является участником споров между заказчиком и подрядчиком – это и признал ВС РФ, удовлетворив кассационную жалобу Альфа-Банка

«Мы изначально были уверены в правоте нашей позиции и удовлетворены решением Верховного суда», – отметил заместитель председателя правления АО «Альфа-Банк» Михаил Гришин.